Přehled klášterů cisterciáků v České republice. Tučně jsou vyznačeny aktivní kláštery, kurzívou kláštery fyzicky již neexistující.
- Strahov (1143)
- Svatý kopeček u Olomouce (1846)
- Želiv
- Proboštství Kněžice
- Jihlava
- Litomyšl
- Převorství Svitavy
- Olomouc-Klášterní Hradisko
- Proboštství Knínice u Boskovic
- Proboštství Oldřišov
- Rezidence Konice
- Rezidence Šebetov
- Rezidence Vřesovice
- Pobočný dům na Svatém Kopečku u Olomouce
- Znojmo-Louka (1190)
- Rezidence Dyje
- Rezidence Budeč
- Rezidence Kravsko
- Rezidence Lechovice
- Rezidence Litohoř
- Rezidence Loděnice
- Rezidence Tasovice
- Milevsko
- Proboštství Toužim
- Teplá (1193)
- Proboštství Hroznětín
- Brno-Zábrdovice
- Rezidence Jesenice
- Rezidence Klobouky
- Rezidence Křtiny
- Nová Říše
- Frýdlant nad Ostravicí-Nová Ves
- Staré Město pražské (1641)
- Liberec
- Rakovník
- Žatec
- Havlíčkův Brod
- Plzeň